Urkundlich 1204 erstmals erwähnt, wurde Weyerburg Mitte des 14. Jahrhunderts zum Markt erhoben. Das Dorf lag ursprünglich südlich der aktuellen Ortschaft, diese frühere Siedlung ist im 15. Jahrhundert jedoch verödet.

Das in Weyerburg befindliche Schloss, früher eine Burg, befand sich in wechselndem Besitz, seit 1714 gehört es der Familie Schönborn, nachdem der damalige Reichsvizekanzler, Graf Friedrich Karl von Schönborn-Puchheim, der spätere Fürstbischof, die Herrschaft Weyerburg nebst anderen dazugehörigen Dörfern vom Grafen Johann Dominik von Hochburg gekauft hatte, um seine 1710 erworbene Herrschaft Göllersdorf zu ergänzen, wo er 1712–1717 das Schloss Schönborn erbauen hat lassen. Anfang des 20. Jahrhunderts war im Gemeindegebiet die Errichtung des Eisenbahnstrecke Stockerau – Joslowitz vorgesehen, an der in Weyerburg eine Station projektiert wurde.

Am 24. Juli 1959 wurde der damals noch Weierburg genannte Ort in Weyerburg umbenannt.

Sehenswürdigkeiten

• Die Filialkirche, geweiht der heiligen Kunigunde, ist ein barockisierter, im Kern mittelalterlicher Saalbau mit einem barocken Hochaltar (vermutlich von Lukas von Hildebrandt), sowie einer spätgotischen Heiligenfigur aus dem 15. Jahrhundert.
• Weithin sichtbar gelegen ist das Schloss, eine im Kern hochmittelalterliche, im 16. Jahrhundert ausgebaute wehrhafte Vierflügelanlage.
• Vor dem Schloss befindet sich eine barocke Figur des heiligen Johannes von Nepomuk aus dem Jahr 1730.
• Die Prangersäule in der Ortsmitte stammt vermutlich aus dem 16. Jahrhundert.
• Südwestlich des Ortes befindet sich eine Pestkapelle aus dem Jahr 1633.
• Beim Follykreuz aus dem 15./16. Jahrhundert südöstlich des Ortes handelt es sich um einen Achtseitpfeiler auf einem Sockel, der unterhalb des profilierten Quaderaufsatzes vier Abwehrköpfe besitzt.

Bürgermeister der ehemaligen Gemeinde Weyerburg

• 1960–1970 Johann Dantner

Ortsvorsteher der Katastralgemeinde Weyerburg

• 1971–1975 Johann Dantner
• 1975–1989 Karl Goldinger
• 1989-2025 Josef Riepl
• seit 2025 Ernst Weilner jun.

Kommandanten der Freiwilligen Feuerwehr Weyerburg

• 1952-1970 Johann Dantner
• 1970-1981 Karl Goldinger
• 1981-2006 Erwin Reisinger
• 2006–2011 Markus Reisinger
• 2011-2014 Christian Frank
• seit 2015 Christof Constantin Chwojka